Details for gene set V$EN1

Table: GSEA Results Summary

Dataset	RNR_GSEA_DESEQ2_FC
Phenotype	NoPhenotypeAvailable
Upregulated in class	na_pos
GeneSet	V$EN1_01
Enrichment Score (ES)	0.23936917
Normalized Enrichment Score (NES)	2.8617952
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	2.504758E-4
FWER p-Value	0.003

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	NRG1	173	1.634	0.0000	Yes
2	CDX2	284	1.253	0.0034	Yes
3	BDNF	380	1.046	0.0076	Yes
4	FIBCD1	429	0.985	0.0144	Yes
5	NR4A3	518	0.871	0.0190	Yes
6	CLC	608	0.757	0.0235	Yes
7	NPR3	709	0.673	0.0275	Yes
8	ELN	835	0.602	0.0301	Yes
9	FOXP2	943	0.550	0.0336	Yes
10	HOXB8	1101	0.482	0.0345	Yes
11	MYOG	1131	0.465	0.0423	Yes
12	HOXA4	1134	0.464	0.0515	Yes
13	SORBS2	1139	0.459	0.0607	Yes
14	HOXC11	1211	0.436	0.0662	Yes
15	RAPGEF5	1304	0.403	0.0705	Yes
16	EFEMP1	1362	0.383	0.0768	Yes
17	KLF15	1379	0.378	0.0853	Yes
18	JAKMIP2	1443	0.358	0.0912	Yes
19	GREM1	1526	0.346	0.0962	Yes
20	FNDC3A	1532	0.345	0.1052	Yes
21	HTR7	1654	0.318	0.1081	Yes
22	PCDH9	1665	0.317	0.1169	Yes
23	OTX2	1672	0.316	0.1259	Yes
24	CREM	1784	0.295	0.1292	Yes
25	RASSF9	1825	0.289	0.1364	Yes
26	AFF4	1849	0.285	0.1445	Yes
27	UTY	1921	0.271	0.1500	Yes
28	PDGFRA	1971	0.264	0.1567	Yes
29	PDZD2	2315	0.227	0.1476	Yes
30	DLG2	2342	0.224	0.1555	Yes
31	EYA4	2479	0.211	0.1575	Yes
32	RDH10	2661	0.196	0.1571	Yes
33	BCOR	2706	0.193	0.1641	Yes
34	NEO1	2876	0.180	0.1643	Yes
35	SREK1	3026	0.171	0.1656	Yes
36	TTC12	3051	0.169	0.1736	Yes
37	SAV1	3084	0.168	0.1813	Yes
38	TCF4	3098	0.167	0.1899	Yes
39	SYNJ2BP	3099	0.167	0.1992	Yes
40	MMP14	3133	0.164	0.2068	Yes
41	FHL1	3145	0.163	0.2156	Yes
42	MAP4K4	3184	0.160	0.2229	Yes
43	UBE2H	3382	0.152	0.2216	Yes
44	GPC3	3438	0.149	0.2279	Yes
45	ATP9B	3923	0.126	0.2112	Yes
46	ANK2	3964	0.124	0.2183	Yes
47	KDM6A	4039	0.121	0.2237	Yes
48	MITF	4098	0.118	0.2299	Yes
49	RARB	4111	0.118	0.2386	Yes
50	SIPA1L1	4271	0.112	0.2394	Yes
51	PLCB1	4793	0.095	0.2206	No
52	CD55	4818	0.094	0.2286	No
53	ATP13A4	5826	0.067	0.1836	No
54	GRIA1	6038	0.061	0.1816	No
55	ERBB4	6124	0.059	0.1863	No
56	RPL38	6212	0.057	0.1910	No
57	PEX2	6387	0.053	0.1909	No
58	SAT1	6492	0.051	0.1947	No
59	GNRH1	6560	0.049	0.2004	No
60	CTCF	7121	0.037	0.1795	No
61	MORF4L2	7219	0.035	0.1836	No
62	SH3BGRL2	7585	0.027	0.1733	No
63	TSHZ3	7646	0.026	0.1794	No
64	CDC14A	8018	0.019	0.1687	No
65	NOTCH1	8959	-0.000	0.1273	No
66	MAP3K5	8961	-0.000	0.1366	No
67	CAMLG	9198	-0.005	0.1332	No
68	ZADH2	9329	-0.008	0.1355	No
69	FGF17	9431	-0.009	0.1394	No
70	GPC4	9486	-0.010	0.1458	No
71	ARHGAP6	9554	-0.012	0.1516	No
72	MAPK14	9949	-0.020	0.1396	No
73	NXF1	10540	-0.031	0.1171	No
74	RNF43	10576	-0.031	0.1246	No
75	TUT1	10846	-0.038	0.1194	No
76	IFT81	10859	-0.038	0.1281	No
77	RGS6	11061	-0.043	0.1266	No
78	NRAS	11153	-0.045	0.1310	No
79	IL1RAPL1	11269	-0.048	0.1342	No
80	TFEB	11369	-0.050	0.1382	No
81	FAM53B	11392	-0.051	0.1463	No
82	RNFT1	11420	-0.052	0.1542	No
83	CWC15	11449	-0.052	0.1621	No
84	LAPTM4B	11454	-0.052	0.1712	No
85	GAP43	11679	-0.058	0.1684	No
86	RTKN	11765	-0.060	0.1732	No
87	RBM4	11787	-0.060	0.1814	No
88	RUNX1T1	11859	-0.062	0.1869	No
89	KDM4D	12151	-0.069	0.1806	No
90	RAB2B	12326	-0.073	0.1805	No
91	RBFOX1	13934	-0.125	0.1031	No
92	PAX6	13970	-0.126	0.1106	No
93	HOXD3	14403	-0.149	0.0966	No
94	IRX4	14420	-0.150	0.1051	No
95	OSR1	15639	-0.242	0.0487	No
96	EOMES	15732	-0.253	0.0530	No
97	RNF39	15827	-0.266	0.0573	No
98	GRHL2	15952	-0.282	0.0600	No
99	SLC6A9	16580	-0.396	0.0355	No
100	OTP	16680	-0.421	0.0395	No
101	HOXA11	17324	-0.646	0.0141	No
102	NOS1	17389	-0.675	0.0200	No
103	LMO1	17604	-0.808	0.0178	No
104	HOXD10	17904	-1.044	0.0110	No
105	SLC6A14	18026	-1.159	0.0138	No
106	ISL1	18181	-1.417	0.0148	No
107	NKX2-2	18541	-3.615	0.0048	No